ISSN 2226-6976 (Print)
ISSN 2414-9640 (Online)

Features of the clinical course and the COVID-19 epidemic process in the communities of various planning patterns

Zadoroshnyi A.V., Pshenichnaya N.Yu., Akimkin V.G.

Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia
Objective. To establish a relationship between the clinical and epidemiological course of COVID-19 and the duration of focal morbidity in the communities of various planning patterns.
Materials and methods. In April 15 to June 2, 2020, the investigators carried out a sampling longitudinal prospective analytical study of the course of the clinical and epidemic process in the COVID-19 foci formed in the communities of various planning patterns. There were a total of 515 COVID-19 cases.
Results. A direct relationship was found between the clinical course and features of the COVID-19 epidemic process and the duration of focal morbidity in the communities of various planning patterns. The analyzed epidemiological indicators: cumulative incidence, morbidity, and incidence density significantly increased by the second incubation period (from day 14 to day 28 since the date of registration of the first case of COVID-19 in the community). The increase in these indicators characterizing the course of the infectious process of COVID-19 was accompanied by an intensive rise in new infection cases and by a change in the clinical course of the disease. This was manifested by an increase in the total number of registered community-acquired pneumonias and a decrease in the period of their development. The increase in the intensity of the epidemic process, the change in the clinical course of COVID-19 and the timing of the development of community-acquired pneumonia directly depended on the duration of the focal process of COVID-19. The long current focus was established to have lower epidemiological indicators in the separate community compared to the reported one.
Conclusion. The long current COVID-19 foci formed in the reported and separate communities are characterized by a more intensive epidemic process; the persons who have got infection in the communities have often a severer clinical course.

Keywords

COVID-19
coronavirus infection
communities
clinical course
intensity
duration

SARS-CoV-2 – высококонтагиозный вирус, основным источником которого являются больные люди, бессимптомные носители и лица, находящиеся в инкубационном периоде. Высокая интенсивность распространения SARS-CoV-2 объясняется простотой реализации механизмов передачи инфекции – респираторного (аэрогенного) и контактно-бытового.

02.03.2020 был зарегистрирован первый случай COVID-19 в Москве. С этого момента в мегаполисе стал отмечаться наивысший уровень заболеваемости COVID-19 по сравнению с другими регионами Российской Федерации, составлявший 30–50% общей заболеваемости в стране, что объясняется высокой численностью населения мегаполиса (12 678 170 чел. по данным Росстата на 01.01.2020); активной внутренней миграцией с высоким ежедневным трафиком; внутренним туризмом,; активным посещением москвичами общественных мест, заведений общепита; высоким уровнем формирований организованных коллективов населения, в том числе в общежитиях.

Высокая частота контактов среди представителей организованных коллективов является основным фактором реализации механизмов передачи COVID-19 с последующим повышением коэффициента распространения вируса. При многократной передаче SARS-CoV-2 внутри человеческой популяции геном вируса подвергается ключевой мутационной изменчивости, инициирующейся в процессе адаптации SARS-CoV-2 к организму человека, в особенности у лиц с иммуносупрессией [1–4]. Ряд мутаций в гене гликопротеина S вируса SARS-CoV2 объясняется увеличением способности вируса к трансмиссии [5].

Организованные коллективы общежитий во время пандемии COVID-19 оказались подвержены серьезной угрозе формирования очаговых форм течения эпидемического процесса новой коронавирусной инфекции.

Простота реализации инфекционного процесса COVID-19 в общежитиях зачастую приводила к формированию длительно текущих крупных очагов .

Клиническая картина COVID-19 определяется как острая респираторная вирусная инфекция (ОРВИ) с рядом возможных осложнений, наиболее опасным из которых является первичная вирусная пневмония. Инкубационный период при COVID-19 колеблется от 2 до 7 сут., редко удлиняется до 14 сут. О большей продолжительности инкубации убедительных данных нет. В течении COVID-19 можно выделить следующие клинические варианты [6, 7].

1. Острое респираторное заболевание с поражением только верхних отделов респираторного тракта.

2. Пневмония без острой дыхательной недостаточности.

3. Пневмония с острой дыхательной недостаточностью и снижением SpO2 < 88% (более чем у 30% пациентов).

4. Острый респираторный дистресс-синдром (3–4% пациентов).

5. Сепсис.

6. Септический (инфекционно-токсический) шок.

По степени тяжести различают легкие (80,9%), среднетяжелые (13,8%) и тяжелые (5,3%) формы COVID-19. Среди инфицированных более 50% составляют лица в возрасте до 45 лет, 34% – от 46 до 65 лет, 4,7% – дети [8].

Метаанализ результатов 31 исследований в общей сложности 46 959 пациентов позволил еще весной 2020 г. обобщить представления о клинической картине COVID-19. Был сделан вывод, указывающий на формирование у 75,7% заболевших двусторонней полисегментарной различной степени тяжести [9].

По данным городского Комитета по туризму, в Москве насчитывается 1860 общежитий, представленных двумя основными типами планировочного устройства: обособленным (373) и сообщенным (1487).

Сообщенные общежития представлены зданиями, имеющими коридорный тип планировочного устройства, который предполагает линейное размещение комнат для проживания постояльцев. На каждом этаже располагаются общие мужские и женские санитарные узлы и душевые комнаты. Кухонное помещение для приготовления пищи является общим для одного или нескольких этажей. Проживание в общежитиях сообщенного типа предполагает наличие постоянных контактов между постояльцами в местах общего пользования. Зачастую жильцы используют общую посуду для приготовления пищи.

К обособленным общежитиям относятся здания, имеющие блочный, квартирный, гостиничный типы планировочного устройства. Они представлены изолированными квартирами, квартирными группами, включающими санитарные узлы, душевые комнаты, помещения, приспособленные для приготовления пищи. В отличие от общежитий сообщенного типа общежития обособленного типа обеспечивают относительно изолированное пребывание постояльцев (жильцов). Доля лиц, недовольных условиями проживания в общежитиях сообщенного типа, была в 1,7 раза больше в сравнении с жителями общежитий обособленного типа. Наиболее существенное влияние на полученные результаты оказали санитарно-гигиеническое состояние общежитий сообщенного типа (им были недовольны 44,1% проживающих) и материально-техническая база, которая не устраивала 53,6% постояльцев [10].

В период с 12.04 по 23.06.2020 очаги COVID-19 были зарегистрированы в 350 общежитиях с числом заболевших 3228 чел.

В проводимом исследовании из представленной генеральной совокупности была сформирована выборка из 2 4-этажных общежитий совмещенного типа с сопоставимым числом заболевших (общежитие А – 195 чел.,, общежитие Б – 215 чел.). В этих общежитиях очаговая заболеваемость COVID-19 протекала с различной интенсивностью. Для подтверждения различного течения клинико-эпидемического процесса в общежитиях различных типов планировочного устройства, в выборку, состоящую из общежитий совмещенного типа, было включено общежитие обособленного типа С.

Сравнение течения клинико-эпидемического процесса в данных общежитиях позволит сформировать вывод о влиянии длительности течения очагового процесса, а также начала и объема проведения противоэпидемических мероприятий на клинические проявления COVID-19 у заболевших и особенности очаговой заболеваемости COVID-19.

Цель исследования – установление связи между тяжестью клинического течения COVID-19 и интенсивностью эпидемического проявления очаговой заболеваемости в общежитиях различного типа планировочного устройства.

Материалы и методы

В период с 15.04 по 02.06.2020 проведено выборочное продольное проспективное аналитическое исследование течения COVID-19 в очагах, сформировавшихся в общежитиях с различным планировочным устройством, в зависимости от длительности течения очагового процесса. Общее число заболевших составило 515 чел.

Отдельные очаги COVID-19 с целью анализа эффективности противоэпидемических мероприятий выбирали на основании оценки эпидемической значимости различных типов очагов групповой заболеваемости. Оценивали среднее количество заболевших, показатель первичной и вторичной (среди контактных лиц) заболеваемости (I), средней длительности существования очага, скорости распространения инфекции (IR), коэффициент распространения коронавируса (Rt), кумулятивной инцендентности (CI) и распространенности (PR). Длительно текущий (хронический) очаг определялся как существующий более 2 максимальных инкубационных периодов (более 28 дней).

При расчете показателей мы использовали следующие формулы:

IR = число новых случаев, выявленных в период наблюдения/численность популяции риска х 10n,

где 10n – временная характеристика наблюдения (дни/недели/месяцы).

I = число впервые выявленных случаев за период наблюдения/численность исследуемой популяции х %; %о.

СI = число людей, у которых развилось заболевание за определенный промежуток времени/популяция риска в тот же период.

PR = число всех выявленных случаев/численность исследуемой популяции.

Rt = (X8 + X7 + X6 + X5)/(X1 + X2 + X3 + X4),

где: Rt – коэффициент распространения коронавируса;

X1…X8 – число зарегистрированных больных коронавирусом за соответствующие сутки.

Для проверки статистической гипотезы применяли р-уровень значимости. Разность между сравниваемыми величинами оценивали с помощью 95% ДИ

Результаты

Очаговый процесс в общежитии А сформировался 15.04.2020 Первый случай COVID-19 был зафиксирован на 2-м этаже. С 15.04 по 29.05.2020 общее число заболевших на 2-м этаже увеличилось на 21 чел. В этот период CI была равна 0,23 (95% ДИ 0,21–0,25). С 30.04 по 14.05 интенсивность распространения COVID-19 увеличилась, CI возросла в 2,5 раза (p < 0,05) и стала равна 0,58 (95% ДИ 0,56–0,61). Общее число заболевших выросло на 31 чел. Из-за особенностей планировочного устройства общежитий сообщенного типа распространение высококонтагиозного вируса SARS-CoV-2 на другие этажи произошло в течение одного инкубационного периода. Инфекционной процесс, реализующийся на 1, 3, 4-м этажах общежития А, отмечался более высокой интенсивностью. Более позднее возникновение первых случаев COVID-19 у постояльцев этих этажей (1-й этаж – 22.04; 3-й этаж – 25.04; 4-й этаж – 28.04) приводило к интенсивному распространению длительно циркулирующего вируса SARS-CoV-2 в этом общежитии.

CI среди проживающих на всех этажах была значительно выше со 02.05, что соответствовало началу второго инкубационного периода SARS-CoV-2 с даты формирования очага (рис. 1).

20-1.jpg (51 KB)

Одним из важнейших эпидемиологических показателей, характеризующих скорость распространения инфекционного процесса, является IR. Особенностью длительно текущего эпидемического процесса COVID-19 в общежитии А явилась высокая интенсивность распространения вируса на 3-м и 4-м этажах с 30.04 по сравнению с 1-м и 2-м этажами (p < 0,05), где были зафиксированы первые случаи COVID-19 (рис. 2).

21-1.jpg (56 KB)

При одинаковом периоде наблюдения достоверное увеличение IR среди проживающих на всех этажах общежития А с 30.04 свидетельствует о повышении активности эпидемического процесса прямо пропорционально дате регистрации первого случая на этаже и длительности существования очага. Об этом свидетельствовали и другие эпидемиологические показатели.

При одинаковом периоде наблюдения достоверное увеличение IR среди проживающих на всех этажах общежития А с 30.04 свидетельствует о повышении активности эпидемического процесса прямо пропорционально дате регистрации первого случая на этаже и длительности существования очага. Об этом свидетельствовали и другие эпидемиологические показатели.

На 4-м этаже, где первый случай COVID-19 был зафиксирован 28.04, отмечен наивысший показатель заболеваемости – 11,34 на 100 чел. (p < 0,05), в то время как на 1–3-м этажах, где первые случаи заболевания начали регистрировать раньше, он не превышал 9,8 на 100 чел.

В свою очередь, длительная циркуляция вируса SARS-CoV-2 на 2-м этаже привела к распространению вируса и формированию интенсивного инфекционного процесса среди проживающих на всех этажах здания. Важным аспектом, свидетельствующим об истиной распространенности COVID-19 на разных этажах, является сопоставимое число постояльцев: 1-й этаж – 135 чел., 2-й – 135 чел., 3-й – 127 чел., 4-й – 141 чел.

Достоверное увеличение показателей CI, I, IR, изменяющихся в зависимости от длительности течения очагового процесса, прослеживалось на всех этажах общежития А. Важную роль играла также дата регистрации первого случая COVID-19 на этаже: чем позже он был зарегистрирован (с момента регистрации первого заболевшего в общежитии), тем интенсивнее проявляется эпидемический процесс.

Первый случай внебольничной пневмонии среди заболевших постояльцев общежития А был зафиксирован 21.04.2020. Данный случай был отмечен у постояльца, заболевшего первым 15.04.2020. До 29.04.2020 было зафиксировано 8 случаев внебольничной пневмонии. Длительность развития клинических симптомов, характеризующих пневмонию составляла 6-8 дней. С 30.04 по 15.05.2020 был зафиксирован 31 случай пневмонии у проживающих лиц. Длительность COVID-19 до развития пневмонии снизилась до 4–5 дней (рис. 3.)

21-2.jpg (167 KB)

Немаловажным является сравнение доли заболевших пневмонией, проживающих на разных этажах: на 1-м – 12,50%, на 2-м – 15,09%, на 3-м – 22,45%, на 4-м – 26,23%, что указывает на зависимость развития тяжелого течения COVID-19 от длительности эпидемического процесса.

При одинаковом типе планировочного устройства 2 4-этажных общежитий совмещенного типа А и Б с сопоставимым числом проживающих (А – 538 чел., Б – 760 чел.) и заболевших (А – 195 чел., Б – 215 чел.) на течение эпидемического процесса COVID-19 наибольшее влияние оказала длительность очагового процесса в этих общежитиях.

Хронический очаг COVID-19 в общежитии А, длившийся с 15.04 в течение 46 календарных дней, характеризовался высокой интенсивностью клинико-эпидемического процесса. В нем были инфицированы 195 чел., из них у 39 чел. были отмечены симптомы пневмонии, у 53 – симптомы ОРВИ, у 101 – бессимптомное течение инфекции.

Для анализа течения клинико-эпидемического процесса в общежитиях в зависимости от длительности COVID-19 нами был исследован очаг новой коронавирусной инфекции во 2-м общежитии совмещенного типа – общежитии Б.

Оно представляло собой 4-этажное здание с большим числом проживающих в сравнении с общежитием А.

В общежитии Б очаг COVID-19, зафиксированный с 18.04 по 09.05.2020, был локализован и ликвидирован значительно раньше. Пик заболеваемости в общежитии Б пришелся на 24.04. С 18.04 по 25.04 там было выявлено 215 случаев COVID-19. Существенные отличия динамики заболеваемости в общежитиях А и Б (t = 2,4; p ≤ 0,05) связаны с большим числом проживающих и контактных лиц в общежитии Б, а также с проведением скринингового обследования постояльцев, позволившего своевременно выявить инфицированных лиц на разных этажах общежития. В отличие от общежития А, в общежитии Б случаев позднего распространения SARS-CoV-2 на этажи, не вовлеченные в формирующийся очаг новой коронавирусной инфекции, отмечено не было. Все случаи инфицирования были выявлены во время, соответствующее первому инкубационному периоду SARS-CoV-2.

Своевременное выявление инфицированных лиц, находящихся в инкубационном периоде, позволило предотвратить формирование длительно текущего очага COVID-19.

Несмотря на интенсивное выявление инфицированных лиц в общежитии Б, распространение COVID-19 в общежитии А происходило быстрее. Средний темп прироста новых случаев в общежитии А был равен 3,0, что выше, чем в общежитии Б, в 1,4 раза (t = 3,2; p ≤ 0,05).

Средний коэффициент распространения (PR) COVID-19 в общежитии Б был ниже в 1,3 раза (t = 2,9; p < 0,05). Данный факт особо важен, если учитывать, что число проживающих в общежитии Б было больше, на 222 чел. Плотное поэтажное заселение в общежитии Б в случае длительного существования очага инфекции могло привести к повышению PR SARS-CoV-2 с интенсивным распространением между проживающими лицами.

Правильная противоэпидемическая тактика, предпринятая в очаге COVID-19 в общежитии Б, позволила не допустить повышения рисков инфицирования для контактных лиц среди постояльцев. Средний показатель CI в общежитии Б был в 1,8 раза ниже, чем в общежитии А (t = 3,3; p < 0,01)

За период наблюдения в общежития Б было зарегистрировано 8 случаев внебольничной пневмонии, 45 случаев ОРВИ и 162 случая бессимптомного течения инфекции. В отличие от общежития А, в котором было отмечено снижение сроков манифестации пневмонии, все 8 случаев заболевания выявлены в срок от 6 дней с момента установления диагноза COVID-19.

При бóльшем числе заболевших в общежитии Б число внебольничных пневмоний было в 4,8 раза ниже, чем в общежитии А, в то время как удельный вес пневмоний в общежитии А был выше в 5,4 раза (t = 2,6; p < 0,05).

Для выявления особенностей течения COVID-19 в очагах, сформировавшихся в общежитиях различных типов, был проведен сравнительный анализ течения инфекционного процесса в общежитиях сообщенного (общежитие А) и обособленного типа (общежитие С).

Общежитие С представляет собой 6-этажное здание обособленного типа с общим числом проживающих– 386 чел. Все постояльцы проживают в изолированных блоках по 3 квартиры.

В общежитии С, как и в общежитии А, был зафиксирован длительно текущий очаг COVID-19. Он длился с 20.04.2020 в течение 46 календарных дней. За период эпидемического неблагополучия было зафиксировано 105 случаев COVID-19 среди проживающих на 2-м и 5-м этажах. На 1-м, 3-м, 4-м и 6-м этажах общежития случаев новой коронавирусной инфекции не зафиксировано, что было связано с низкой кратностью контактов среди постояльцев в сравнении с общежитием А.

В связи с этим наблюдались различия в динамике уровня заболеваемости. В общежитии А она имела длительный период положительной динамики, который на 9 дней превысил аналогичный период в общежитии С (t = 1,9; p ≤ 0,05). Средний уровень заболеваемости в общежитии А в сравнении с общежитием С также был выше в 1,3 раза (p ≤ 0,05).

Особенности планировочного устройства обособленных общежитий, в отличие от сообщенных, позволяют избежать высокой частоты контактов среди постояльцев. Это обеспечивает низкую распространенность инфекции в обособленном общежитии С – 0,30 против 0,36 в общежитии А (95% ДИ 0,28–20,32 и 0,34–0,37 соответственно).

Коэффициент Rt, показывающий, сколько контактных лиц может заразить 1 инфицированный, также был ниже в общежитии С – 0,25 против 3,0 в общежитии А (95% ДИ 2,5–2,7 и 2,9–3,1 соответственно).

В общежитии С после 1 инкубационного периода CI увеличилась на 2-м этаже в 2,8 раза, на 5-м – в 2,8 раза, тогда как на 4-м этаже общежития А этот показатель увеличился в 66 раз, а на 3-м – в 17 раз.

За весь период эпидемического неблагополучия в общежитии С было зафиксировано 2 случая внебольничной пневмонии, что в 19,5 раза ниже по сравнению с числом пневмоний, зафиксированных в общежитии А.

Обсуждение

Длительное течение очагового процесса в общежитии А привело к увеличению CI за 1 инкубационный период. CI на всех этажах увеличилась: на 1-м этаже в 2 раза, на 2-м – в 2,5 раза , на 3-м – в 17 раз и на 4-м – 66 раз. Отмеченная закономерность связана с длительностью циркуляции SARS-CoV-2 и повышением контагиозности вируса.

Этот факт подтверждают и результаты исследования, проведенного сотрудниками ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России: скорость передачи инфекции определяется базовым репродуктивным числом R (ожидаемое количество вторичных случаев заражения, вызванное одной инфекцией в полностью восприимчивой популяции). С учетом возможных ошибок, связанных с выбором модели расчета и временного интервала оценки, предположительно для SARS-CoV-2 показатель R1, зарегистрированный в начале пандемии, в период проведения исследования составлял 2,68 [11].

Динамика других эпидемиологических показателей также свидетельствовала о повышении распространенности вируса с истечением одного инкубационного периода. Учитывая сопоставимое чис ло проживающих на 1–4-м этажах, более поздняя регистрация 1-го случая COVID-19 на 4-м этаже сопровождалась наивысшей заболеваемостью, I = 11,34 (95% ДИ 10,70–11,86) и IR = 4,28 (95% ДИ 4,18–4,50). C увеличением периода эпидемического неблагополучия в общежитии А также участилась регистрация случаев внебольничных пневмоний. Так, с даты регистрации очага до 29.04.2020 было зарегистрировано 8 случаев пневмонии, в то время как с 30.04 по 15.05 был зафиксирован 31 случай заболевания со снижением длительности развития характерных симптомов до 4 дней. При одинаковом типе планировочного устройства 2 4-этажных общежитий совмещенного типа А и Б, сопоставимом числе проживающих и заболевших тяжесть клинико-эпидемического процесса COVID- 19 оказалась в прямой зависимости от длительности существования очага. В общежитии Б позднего распространения SARS-CoV-2 на этажи, не вовлеченные в формирующийся очаг COVID-19, отмечено не было. Все случаи инфицирования были выявлены во время, соответствующее первому инкубационному периоду SARS-CoV-2. Своевременно проведенное скрининговое исследование проживающих позволило одномоментно выявить большое число инфицированных постояльцев, находящихся в инкубационном периоде заболевания и проживающих на разных этажах общежития, а предпринятые меры позволили исключить формирование длительно текущего очага и способствовали формированию существенных различий в динамике заболеваемости в общежитиях А и Б (t = 2,4; p ≤ 0,05). Общее число зафиксированных случаев пневмонии в общежитии Б было ниже в 4,8 раза. Факт повышения трансмиссивности возбудителя COVID- 19, прямо коррелирующий с длительностью существования очага инфекции был также подтвержден зарубежными учеными: частота инфицирования проживающих при частых и тесных контактах в крупных очагах COVID- 19 возрастала до 27% [12, 13].

Сравнительный анализ течения COVID-19 в очагах, сформировавшихся в общежитиях различного типа (сообщенном общежитии А и обособленном общежитии Б), показал, что особенности планировочного устройства общежитий кардинально влияют на характеристики очаговой заболеваемости. На это обратили внимание авторы исследования, в котором были выявлены множественные пики передачи инфекции, включающие по меньшей мере 5467 случаев заражения SARS-CoV-2 в 6 общежитиях. Было установлено, что число случаев заражения SARS-CoV-2 удваивалось каждые 1,56 дня (95% ДИ 1,29–1,96) в зданиях сообщенного типа, а е время удвоения для квартирных (обособленных) общежитий составило 2,65 дня (95% ДИ 2,01–3,87) [14].

Нами показано, что при сравнительно равном числезаболевших в общежитиях А и С динамика заболеваемости имела существенные различия и характеризовалась более низким уровнем среди проживающих в общежитии С (t = 1,9; p ≤ 0,05).

Особенности планировочного устройства обособленных общежитий позволили снизить кратность контактов среди проживающих, что обеспечило низкую распространенность инфекции в них при длительно текущем очаговом процессе.

Заключение

Таким образом, длительность очаговой заболеваемости COVID-19 является одним из основополагающих факторов, влияющих на интенсивность эпидемического процесса в общежитиях как сообщенного, так и обособленного типа.

Длительно текущие очаги COVID-19 в общежитиях характеризуются высокой заболеваемостью с колоссальными рисками распространения инфекции. Высокая контагиозность и затяжная циркуляция вируса приводят к увеличению темпов распространения SARS-CoV-2, что ведет к быстрой манифестации симптомов пневмонии у заболевших.

Планировочное устройство общежитий оказывает значительное влияние на формирование эпидемического процесса в них и, как следствие, объясняет формирование различий в проявлении клинических симптомов инфекционного процесса COVID-19 у заболевших.

References

1. Wenjie T., Xiang Z., Xuejun M., Wenling W., Peihua N., Wenbo X. et al. Notes from the Field: A Novel Coronavirus Genome Identified in a Cluster of Pneumonia Cases – Wuhan, China 2019–2020. China CDC Weekly 2020; 2(4): 61–2. http://weekly.chinacdc.cn/en/article/id/a3907201-f64f-4154-a19e-4253b453d10с

2. Kucharski A. J., Russell T. W., Diamond C., Liu Y., Edmunds J., Funk, S. et al. Early dynamics of transmission and control of COVID-19: a mathematical modelling study. Lancet Infect Dis. 2020; 20(5): 553–8. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30144-4

3. Kupferschmidt K. The pandemic virus is slowly mutating. But does it matter? Science 2020; 369(6501): 238–9. DOI: 10.1126/science.369.6501.238

4. Bhattacharyya Ch., Das Ch., Ghosh A., Singh A.K., Mukherjee S., Majumder P.P. et al. Global spread of SARS-CoV-2 subtype with spike protein mutation D614G is shaped by human genomic variations that regulate expression of TMPRSS2 and MX1 genes. bioRxiv 2020.05.04.075911. DOI: 10.1101/2020.05.04.075911

5. Краснов Я.М., Попова А.Ю., Сафронов В.А., Федоров А.В., Баданин Д.В. и др. Анализ геномного разнообразия SARS-CoV-2 и эпидемиологических признаков адаптации возбудителя COVID-19 к человеческой популяции (Сообщение 1). Проблемы особо опасных инфекций 2020; (3): 70–82. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-70-82

Krasnov, Ya. M., Popova, A. Yu., Safronov, V. A., Fedorov, A.V., Badanin, et al. [Analysis of the genomic diversity of SARS-CoV-2 and epidemiological signs of adaptation of the pathogen COVID-19 to the human population (Communication 1)]. Problems of Particularly Dangerous Infections 2020; (3): 70–82. (In Russ.). DOI: 10.21055 / 0370-1069-2020-3-70-82

6. Временные методические рекомендации «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)». Версия 11 (07.05.2021). Минздрав России, 2021.https://base.garant.ru/400738625/

[Temporary guidelines «Prevention, diagnosis and treatment of new coronavirus infection (COVID-19)»]. Version 11 (05/07/2021). Ministry of Health of the Russian Federation, 2021. (In Russ.). https://base.garant.ru/400738625/7.

7. Никифоров В.В., Колобухина Л.В., Сметанина С.В., Мазанкова Л.Н., Плавунов Н.Ф., Щелканов М.Ю. и др. Новая коронавирусная инфекция (COVID-19): этиология, эпидемиология, клиника, диагностика, лечение и профилактика. Учебно-методическое пособие. М.: Департамент здравоохранения города Москвы, 2020. 71 с.

Nikiforov V.V., Kolobukhina L.V., Smetanina S.V., Mazankova L.N., Plavunov N.F., Shchelkanov M.Yu.et al. [Novel coronavirus infection (COVID-19): etiology, epidemiology, clinic, diagnosis, treatment and prevention]. Study guide. Moscow: Moscow City Health Department, 2020. 71 p. (In Russ.).

8. Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Бургасова О.А., Кружкова И.С., Малеев В.В. COVID-19: этиология, клиника, лечение. Инфекция и иммунитет 2020; 10(3): 421–45. doi: 10.15789/2220-7619- CEC-147

Shchelkanov M.Yu., Kolobukhina L.V., Burgasova O.A., Kruzhkova, I.S., Maleev, V.V. [COVID-19: etiology, clinic, treatment–. Infection and immunity 2020; 10(3): 421–45 (In Russ.). doi:10.15789/2220-7619-CEC-147

9. Cao Y., Liu X., Xiong L., Cai K. Imaging and clinical features of patients with 2019 novel coronavirus SARS-CoV-2: a systematic review and meta-analysis. J. Med. Virol. 2020; 92(9): 1449–59. doi: 10.1002/jmv.25822

10. Ганина О.А. Организация быта в университетских общежитиях разного типа. Вестник ПНИПУ. Социально-экономические науки 2018; (4): 82–97. https://cyberleninka.ru/article/n/organizatsiya-byta-v-universitetskih-obschezhitiyah-raznogo-tipa.

Ganina O.A. [Organization of everyday life in university dormitories of different types]. Bulletin of Perm State Technical University. Socio-economic sciences 2018; (4): 82–97. (In Russ.). https://cyberleninka.ru/ article/n/organizatsiya-byta-v-universitetskih-obschezhitiyah-raznogo-tipa

11. Белоцерковская Ю.Г., Романовских А.Г., Смирнов И.П. COVID-19: респираторная инфекция, вызванная новым коронавирусом: новые данные об эпидемиологии, клиническом течении, ведении пациентов. Consilium Medicum 2020; 22(3): 12–20. DOI: 10.26442/20751753.2020. 3.200092

Belotserkovskaya Yu.G., Romanovskikh A.G., Smirnov I.P. [COVID-19: Respiratory Infection Caused by Novel Coronavirus: New Evidence on Epidemiology, Clinical Course, Patient Management]. Consilium Medicum 2020; 22(3): 12–20. (In Russ.). DOI: 10.26442 /20751753.2020.3.200092

12. McAloon, K., Collins,A., Hunt, K., Barber, A., Byrne, A. On., Butler et al. до 6 авторов The incubation period of COVID-19 – A rapid systematic review and meta-analysis of observational research. MedRxiv and bioRxiv 2020. doi: 10.1101/ 2020.04.24.20073957

13. Wang F.S., Zhang C. What to do next to control the 2019-nCoV epidemic? Lancet 2020; 395(10222): 391–3. doi: 10.1016/ S0140-6736(20)30300-7

14. Gorny A.W., Bagdasarian N., Koh A.H., Lim Y.C., Ong J.S., Ng B.S. et al. SARS-CoV-2 in migrant worker dormitories: Geospatial epidemiology supporting outbreak management. Int. J. Infect. Dis. 2021; 103: 389–94. doi.org/10.3390/ijerph18179125

About the Authors

Alexander V. Zadorozhnyi, Resident, Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; AlezanderZadoroshnyy@yandex.ru
Professor,Natalia Yu. Pshenichnaya, MD, Deputy Director on Clinical and Analytical Work, Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; natalia-pshenichnaya@yandex.ru; https://orcid.org/0000-0003-2570-711X
Professor Vasiliy G. Akimki, MD, Academician of the Russian Academy of Sciences, Director, Central Research Institute of Epidemiology, Russian Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Well-Being, Moscow, Russia; vgakimkin@yandex.ru; http://orcid.org/ 0000-0003-4228-9044

Similar Articles

By continuing to use our site, you consent to the processing of cookies that ensure the proper functioning of the site.